还珠格格第三部的结局是小燕子和永琪，晴儿和肖剑一起离开了宫廷，隐姓埋名生活在民间。紫薇嫁给了尔康，仍然生活在学士府，她时常入宫，同知画成了知心好友。
很多年后，年迈的乾隆在尔康的陪伴下，再下江南，特地去看了永琪小燕子晴儿他们，看见他们在民间生活得很幸福，每人家里都有了几个孩子，乾隆也放下心来，剧中的每个主角都收获了幸福的结局。
本来当初含香和蒙丹是打算和小燕子他们一起去云南大理的，但是因为尔康说这样太引人注目了，所以后来还是坚持让含香和蒙丹单独逃亡。不过从这件事来看，他们当时的目标都是一样的，那就是去云南大理。
紫薇跪拜告别皇上、太后等，行将出嫁。紫薇向令妃磕头，感谢她多年的照顾。才子美女再次“气儿力顶”，送别紫薇。洞房中，紫薇与尔康以身上的疤痕为引，展开一番追忆与告白。一只山羊离群，小燕子追至山林而迷路。 突降大雨，小燕子躲至山洞，又冷又饿又怕。班杰明冒雨赶来，二人顿时相拥。班杰明脱下衣服给小燕子穿，自己着了凉，回家后咳嗽一夜并发烧，小燕子尽心照顾他。欣荣有喜，愉妃十分高兴。永琪认为任务已完成一半，孩子将是他留给额娘的希望。班杰明醒来，将趴在床边睡着的小燕子画下。欣荣生下儿子，永琪即向皇上辞行。 皇上尊重其选择，并称若他三年未归，将宣告其去世。永琪带着新写的信和燕子钟，在孩子满月之时孤身骑马出宫，尔康和已有身孕的紫薇在半路等候相送。小燕子和永琪在早已超过约定期限的某日终于再相会。班杰明告别箫剑一人，策马离去。
第一部的大结局：夏紫薇和小燕子把自己的故事告诉了乾隆，后面乾隆选择原谅他们几个，封了小燕子为还珠郡主赐婚给五阿哥，封夏紫薇为明珠格格赐婚给福尔康，尔泰娶了塞娅公主
第一部正式册封紫薇明珠格格，小燕子还珠郡主，分别为紫薇尔康，小燕子和永琪赐婚。
第二部紫薇尔康与小燕子永琪结婚。
第三部紫薇尔康回宫，小燕子永琪和晴儿萧剑留在云南，也都有了孩子，最后结尾尔康陪皇上去云南看完小燕子永琪晴儿萧剑
《还珠格格》大结局：永琪小燕子、箫剑晴儿留在了云南，婚后还有了孩子，紫薇尔康还有知画则是留在了皇宫中，在皇上年老的时候还曾经一起去过云南探望他们，各自都有了各自幸福的结局。《还珠格格》第一、二部中主要围绕着紫薇和小燕子的身份展开，从真假格格到后来的还珠格格和明珠格格身份的敲定，小燕子、紫薇还有永琪、尔康等人是经历了重重困难，好在最后他们都是有惊无险的度过了这些难关。
小燕子没有和五阿哥白头到老，半路分手转投另一样位黄阿哥怀抱，非法经营，被人民唾弃。
紫薇同样为了抛弃尔康，故意摸黑尔康，最终老死不相往来。
1.还珠格格的结局是永琪和小燕子还有紫薇和尔康都回到了紫禁城，并且举办了婚礼。
2.在《还珠格格》的结局当中，会宾楼重新热闹开张，箫剑和乾隆间的仇恨也在慢慢了解中退去，箫剑也总算认识了有人情味的皇帝，皇后与容嬷嬷此番是痛定思痛。
3听闻紫薇和小燕子即将举行婚礼，两人连夜赶工为小燕子、紫薇细心缝制新娘装，而小燕子也不计前嫌的原谅了皇后与容嬷嬷，婚礼当天皇宫里张灯结彩，尤其漱芳斋是一阵忙乱，轰轰烈烈的爱情果然也有惊心动魄的婚礼，两位新郎倌竟然娶错了新娘
尔康和紫薇留在了京城，紫薇也怀上了二胎，小燕子永琪 箫剑和晴儿去了云南，结局的时候尔康带着皇上去云南看了他们
永琪和小燕子，尔康和紫薇结婚！
第一部:紫薇和乾隆相认，
第二部:紫薇，尔康，小燕子，永琪成亲
第三部:众人相聚云南