作品故事时间线顺序如下：仙剑奇侠传四→仙剑奇侠传三→仙剑奇侠传三外传·问情篇→仙剑奇侠传→仙剑奇侠传二→仙剑奇侠传五前传→仙剑奇侠传七 → 仙剑奇侠传五→仙剑奇侠传六。
仙剑奇侠传1中出现的王小虎是小孩，到了仙剑奇侠传2成为主角，仙剑奇侠传2中李逍遥30多岁，所以仙剑奇侠传2在仙剑奇侠传1之后十几年，仙剑奇侠传3的剧情是以景天为主角，而景天是李逍遥之父李三思的师傅，所以仙剑奇侠传3在仙剑奇侠传1之前。
仙剑奇侠3外传的剧情中，南宫煌与李三思年纪相仿，而在外传中的景天已经成家，并开了自己的当铺，所以仙剑奇侠3外传是在仙剑奇侠传3之后几年。
仙剑4与前3代的联系不是很大。唯一的线索是在不周山的一个隐藏支线剧情。慕容紫英在不周山发现了魔剑和修行尚浅、未修炼成人形的龙葵，慕容紫英将魔剑装入剑匣，在仙剑4结尾乘魔剑离去。而仙剑5中提到“上古琼华”，可见仙剑4是在3代之前很久一段时间。
仙剑5中提到过消灭水魔兽、剿灭拜月教是在30多年前的事情，而仙剑5中的一贫被玩家公认是李逍遥(仙剑5的官方设定中，一贫的年龄为58岁)，而海棠夫人是则阿奴。所以仙剑5的时间是在1代剧情的30多年后。
前4部的时间顺序是3、3外、1、2
后面的剧情我不太熟
之间有好几条明暗线相关联，女娲后人、飞龙探云手的传承、蜀山掌门等等