结局是：狄仁杰与李元芳等与欲置武皇于死地的反派势力斗智斗勇，最终粉碎了国师的谋逆阴谋。
武周时代的一年春天，江州情花观那株天下独有的情花突然枯而复荣，并绽放出惊人的血色，一时间人心惶惶，谣言纷起，矛头直指国体，威胁到了朝政安全。为此，大周皇帝武则天特派太子李旦前往镇抚，不料李旦却于抵达江州后神秘地失踪了。
大案惊天，狄仁杰奉旨前往江州调查，几经坎坷勘破重重迷雾，与助手李元芳深入虎穴，舍生忘死，与齐聚江州的三教九流各色人等，特别是以假刺史窦天德、情花观观主栖霞、一代画师宇文驰与多年逍遥法外的羿阳郡主李青霞为代表的阴谋势力，展开了扑朔迷离、诡谲凶险的智勇比拼，最终大破情花案，迎回了太子，制止了动乱。
神探狄仁杰第5部》又名《狄仁杰之琼花金人案》是由《神探狄仁杰》系列的制作班底全力打造，讲述了狄仁杰与助手李元芳深入虎穴，与对手展开智勇比拼，破获以《琼花案》和《金人案》为代表的一连串谜案。据悉，《狄仁杰5》是以单元的剧式对狄仁杰侦破案件的故事进行全新的揭秘与解读，故事性更强、更耐看，而在服装、道具、布景上的别具匠心也令该剧更具观赏性。该剧由张文玲担任总制片人，谭友业担任总导演，已于2013年10月前后开机。
第五部《神探狄仁杰》是有两个案件的，一个叫《情花案》，另一个叫《金人案》。《情花案》更多的是反转，最后凶手伏法，《金人案》感觉还有后续，凶手更多的是为了自己，人物比较奇特。